Arkitektskolens forskningsaktiviteter er forankret i fem institutter med hver sit fagligt-strategiske indsatsområde og udføres dels som led i større, tværinstitutionelle forskningsprogrammer, dels som individuel forskning inden for rammerne af det enkelte instituts forskningsplatform. De fire institutter er

Institut for Arkitektur

Institut for By og Landskab

Institut for Arkitektonisk Kulturarv

Institut for Design

Skolens ph.d.-studerende er tilknyttet institutterne, og en fælles forskerskole, der både tilrettelægger og afvikler forskeruddannelseskurser og fungerer som et samlende miljø for forskeruddannelsen.

Skolens forskningsaktiviteter forvaltes af Forskningssekretariatet i samarbejde med Forskningsudvalget, der er nedsat af Skolerådet.